Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chchd2Q9D1L0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd2Q9D1L0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chchd2Q9D1L0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chchd2Q9D1L0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd2Q9D1L0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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