Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D1F3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D1F3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D1F3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D1F3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D1F3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D1F3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D1F3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D1F3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D1F3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D1F3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D1F3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D1F3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D1F3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms