Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc77Q9CZH8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc77Q9CZH8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc77Q9CZH8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc77Q9CZH8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms