Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
3300002I08RikQ9CXH3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
3300002I08RikQ9CXH3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms