Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npm3Q9CPP0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Npm3Q9CPP0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Npm3Q9CPP0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npm3Q9CPP0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms