Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rnf17Q99MV7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Rnf17Q99MV7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rnf17Q99MV7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rnf17Q99MV7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rnf17Q99MV7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rnf17Q99MV7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rnf17Q99MV7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rnf17Q99MV7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rnf17Q99MV7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rnf17Q99MV7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rnf17Q99MV7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rnf17Q99MV7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rnf17Q99MV7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rnf17Q99MV7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rnf17Q99MV7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rnf17Q99MV7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rnf17Q99MV7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rnf17Q99MV7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms