Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms