Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cmtm3Q99LJ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cmtm3Q99LJ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm3Q99LJ5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms