Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nlgn1Q99K10 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nlgn1Q99K10 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nlgn1Q99K10 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nlgn1Q99K10 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nlgn1Q99K10 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms