Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP9

Necab2, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab2Q91ZP9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab2Q91ZP9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab2Q91ZP9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab2Q91ZP9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab2Q91ZP9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Necab2Q91ZP9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab2Q91ZP9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab2Q91ZP9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab2Q91ZP9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab2Q91ZP9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab2Q91ZP9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab2Q91ZP9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab2Q91ZP9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms