Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y21

Pcdha1, Protocadherin alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha1Q91Y21 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha1Q91Y21 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha1Q91Y21 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha1Q91Y21 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha1Q91Y21 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha1Q91Y21 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.4 ms