Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmcd1Q8VEE1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmcd1Q8VEE1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmcd1Q8VEE1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms