Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD75

Hip1, Huntingtin-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1Q8VD75 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hip1Q8VD75 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hip1Q8VD75 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hip1Q8VD75 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hip1Q8VD75 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hip1Q8VD75 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms