Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc58Q8R3Q6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc58Q8R3Q6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc58Q8R3Q6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc58Q8R3Q6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc58Q8R3Q6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc58Q8R3Q6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc58Q8R3Q6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc58Q8R3Q6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms