Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3H0

Appl1, DCC-interacting protein 13-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Appl1Q8K3H0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Appl1Q8K3H0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Appl1Q8K3H0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Appl1Q8K3H0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Appl1Q8K3H0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms