Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrtm1Q8K377 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrtm1Q8K377 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrtm1Q8K377 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms