Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssh3Q8K330 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssh3Q8K330 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh3Q8K330 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh3Q8K330 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms