Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2G4

Bbs7, Bardet-Biedl syndrome 7 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs7Q8K2G4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bbs7Q8K2G4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bbs7Q8K2G4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bbs7Q8K2G4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bbs7Q8K2G4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms