Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spire2Q8K1S6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Spire2Q8K1S6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Spire2Q8K1S6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spire2Q8K1S6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spire2Q8K1S6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Spire2Q8K1S6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spire2Q8K1S6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spire2Q8K1S6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spire2Q8K1S6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Spire2Q8K1S6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms