Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sde2Q8K1J5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sde2Q8K1J5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sde2Q8K1J5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms