Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ27

Aspm, Abnormal spindle-like microcephaly-associated protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AspmQ8CJ27 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AspmQ8CJ27 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AspmQ8CJ27 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AspmQ8CJ27 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AspmQ8CJ27 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AspmQ8CJ27 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AspmQ8CJ27 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms