Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN1

Nlrp10, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp10Q8CCN1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp10Q8CCN1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp10Q8CCN1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp10Q8CCN1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp10Q8CCN1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp10Q8CCN1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp10Q8CCN1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms