Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Spef2Q8C9J3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Spef2Q8C9J3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Spef2Q8C9J3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Spef2Q8C9J3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Spef2Q8C9J3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms