Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgif2Q8C0Y1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgif2Q8C0Y1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgif2Q8C0Y1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgif2Q8C0Y1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgif2Q8C0Y1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgif2Q8C0Y1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgif2Q8C0Y1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgif2Q8C0Y1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgif2Q8C0Y1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tgif2Q8C0Y1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgif2Q8C0Y1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgif2Q8C0Y1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms