Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTM9

Rasgrp4, RAS guanyl-releasing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp4Q8BTM9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rasgrp4Q8BTM9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rasgrp4Q8BTM9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rasgrp4Q8BTM9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rasgrp4Q8BTM9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rasgrp4Q8BTM9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rasgrp4Q8BTM9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rasgrp4Q8BTM9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms