Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Usp54Q8BL06 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Usp54Q8BL06 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp54Q8BL06 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Usp54Q8BL06 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms