Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rspo4Q8BJ73 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rspo4Q8BJ73 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rspo4Q8BJ73 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rspo4Q8BJ73 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rspo4Q8BJ73 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rspo4Q8BJ73 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rspo4Q8BJ73 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rspo4Q8BJ73 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rspo4Q8BJ73 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rspo4Q8BJ73 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rspo4Q8BJ73 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 884.4 ms