Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr2eQ80UW8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr2eQ80UW8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr2eQ80UW8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms