Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttll4Q80UG8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttll4Q80UG8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttll4Q80UG8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttll4Q80UG8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttll4Q80UG8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttll4Q80UG8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttll4Q80UG8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ttll4Q80UG8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ttll4Q80UG8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttll4Q80UG8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll4Q80UG8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll4Q80UG8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms