Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdh8Q7TSK3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh8Q7TSK3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdh8Q7TSK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdh8Q7TSK3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms