Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nphp3Q7TNH6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nphp3Q7TNH6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphp3Q7TNH6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp3Q7TNH6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nphp3Q7TNH6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms