Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y3

Picalm, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PicalmQ7M6Y3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PicalmQ7M6Y3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PicalmQ7M6Y3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PicalmQ7M6Y3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PicalmQ7M6Y3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PicalmQ7M6Y3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PicalmQ7M6Y3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PicalmQ7M6Y3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PicalmQ7M6Y3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PicalmQ7M6Y3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PicalmQ7M6Y3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PicalmQ7M6Y3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PicalmQ7M6Y3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms