Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms