Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clca4aQ6Q473 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clca4aQ6Q473 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clca4aQ6Q473 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clca4aQ6Q473 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clca4aQ6Q473 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clca4aQ6Q473 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clca4aQ6Q473 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clca4aQ6Q473 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms