Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc4Q6PHQ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc4Q6PHQ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc4Q6PHQ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc4Q6PHQ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms