Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ecm29Q6PDI5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ecm29Q6PDI5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ecm29Q6PDI5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ecm29Q6PDI5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms