Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Caskin1Q6P9K8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Caskin1Q6P9K8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Caskin1Q6P9K8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Caskin1Q6P9K8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Caskin1Q6P9K8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Caskin1Q6P9K8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Caskin1Q6P9K8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Caskin1Q6P9K8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Caskin1Q6P9K8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Caskin1Q6P9K8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Caskin1Q6P9K8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Caskin1Q6P9K8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Caskin1Q6P9K8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Caskin1Q6P9K8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms