Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg16l2Q6KAU8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg16l2Q6KAU8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms