Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ablim3Q69ZX8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ablim3Q69ZX8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ablim3Q69ZX8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ablim3Q69ZX8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ablim3Q69ZX8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms