Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfe3Q64092 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfe3Q64092 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tfe3Q64092 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfe3Q64092 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfe3Q64092 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfe3Q64092 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfe3Q64092 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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