Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CochQ62507 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CochQ62507 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CochQ62507 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CochQ62507 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CochQ62507 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CochQ62507 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CochQ62507 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CochQ62507 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CochQ62507 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CochQ62507 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CochQ62507 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CochQ62507 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CochQ62507 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CochQ62507 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CochQ62507 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CochQ62507 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CochQ62507 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CochQ62507 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CochQ62507 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CochQ62507 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CochQ62507 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CochQ62507 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CochQ62507 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CochQ62507 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CochQ62507 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CochQ62507 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CochQ62507 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CochQ62507 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CochQ62507 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CochQ62507 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CochQ62507 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CochQ62507 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CochQ62507 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CochQ62507 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CochQ62507 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CochQ62507 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CochQ62507 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CochQ62507 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CochQ62507 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CochQ62507 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CochQ62507 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CochQ62507 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CochQ62507 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CochQ62507 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CochQ62507 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CochQ62507 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CochQ62507 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CochQ62507 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CochQ62507 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CochQ62507 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CochQ62507 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CochQ62507 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CochQ62507 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CochQ62507 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CochQ62507 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CochQ62507 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CochQ62507 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CochQ62507 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CochQ62507 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CochQ62507 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CochQ62507 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CochQ62507 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CochQ62507 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CochQ62507 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CochQ62507 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CochQ62507 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CochQ62507 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CochQ62507 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CochQ62507 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CochQ62507 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CochQ62507 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CochQ62507 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CochQ62507 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CochQ62507 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CochQ62507 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CochQ62507 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CochQ62507 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CochQ62507 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CochQ62507 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CochQ62507 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CochQ62507 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CochQ62507 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CochQ62507 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CochQ62507 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CochQ62507 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CochQ62507 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CochQ62507 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CochQ62507 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CochQ62507 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CochQ62507 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CochQ62507 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CochQ62507 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CochQ62507 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CochQ62507 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CochQ62507 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CochQ62507 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CochQ62507 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CochQ62507 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CochQ62507 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms