Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnrpcQ62241 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpcQ62241 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms