Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Astn1Q61137 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Astn1Q61137 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Astn1Q61137 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Astn1Q61137 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms