Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samhd1Q60710 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samhd1Q60710 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Samhd1Q60710 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms