Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Specc1Q5SXY1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Specc1Q5SXY1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Specc1Q5SXY1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Specc1Q5SXY1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Specc1Q5SXY1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms