Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r195Q5SVD6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r195Q5SVD6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms