Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fbxo39Q5NBU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo39Q5NBU5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo39Q5NBU5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms