Protein–RNA interactions for Protein: Q569Z5

Ddx46, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX46, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx46Q569Z5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx46Q569Z5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx46Q569Z5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx46Q569Z5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx46Q569Z5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx46Q569Z5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx46Q569Z5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx46Q569Z5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx46Q569Z5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx46Q569Z5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx46Q569Z5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ddx46Q569Z5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx46Q569Z5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms