Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1T4

P3h1, Prolyl 3-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3h1Q3V1T4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
P3h1Q3V1T4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P3h1Q3V1T4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P3h1Q3V1T4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P3h1Q3V1T4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
P3h1Q3V1T4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3h1Q3V1T4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3h1Q3V1T4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P3h1Q3V1T4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P3h1Q3V1T4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P3h1Q3V1T4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P3h1Q3V1T4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P3h1Q3V1T4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms