Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
4930567H17RikQ3V0K5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
4930567H17RikQ3V0K5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4930567H17RikQ3V0K5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
4930567H17RikQ3V0K5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms